Misophoniker können die Reaktionen welche durch ihre Trigger ausgelöst werden nicht unterbinden. Sie erfolgen unmittelbar in voller Stärke, und es dauert unter Umständen Stunden bis sich der Betroffene wieder beruhigt. Häufig wird das Triggergeräusch im Kopf weiter wiederholt und kann von der betroffenen Person nicht kontrolliert werden.

Um besser zu verstehen, was genau in unserem Gehirn bei diesen Vorgängen abläuft, sollten wir uns drei wichtige Gehirnregionen anschauen:

- das Grosshirn: hier sind rationale Gedanken verankert, z.B. "Alles in Ordnung, ich muss ruhig bleiben"

- der Hirnstamm: dort findet sich das vegetative Nervensystem, zuständig für Reflexe und besitzt eine wichtige Bedeutung

  für die Reaktionen bei Misophonie

- das limbische System: ist für unsere Emotionen zuständig

Vordergründig scheint es, als ob die extremen Emotionen eine direkte Reaktion auf einen Trigger darstellen. Dabei handelt es sich allerdings um eine falsche Ausgangslage. Trigger lösen nicht direkt die Emotionen aus, sondern einen körperlichen Reflex. Erst dieser Muskelreflex erzeugt die extremen Emotionen.

Dieser unfreiwillige Muskelreflex ist bei Betroffenen individuell verschieden. Manche körperliche Reflexe sind kaum wahrnehmbar, wie z.B. eine ruckartige Bewegung des Kopfes oder ein Augenzucken. Andere hingegen sind stark ausgeprägt, beispielsweise die Muskelanspannung des Nackens, der Schultern, des Brustkorbs, der Arme oder des Gesichts. Auch von geballten Händen, Füßen, Beinen, Zehen oder der Gesäßmuskulatur wird berichtet.

Manchmal erfolgen die Reflexe aber  auch im Körper, verbunden mit Übelkeit im Magen oder in der Speiseröhre, sexueller Erregung oder verstärktem Harndrang. Davon betroffen kann ein einzelner, oder auch mehrere Muskeln sein.

Die individuell unterschiedlichen körperlichen Reaktionen bestätigen, dass Misophonie keine plötzlich auftretende genetische Störung darstellt, sondern dass es sich dabei um eine Neurologische Erkrankung handelt und sich aus den Erfahrungen der jeweiligen Person heraus entwickelt.